Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg3Q9CPX6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg3Q9CPX6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms