Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ska1Q9CPV1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ska1Q9CPV1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms