Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930519G04RikQ9CPT7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms