Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CPS8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms