Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim26Q99PN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim26Q99PN3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms