Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rrbp1Q99PL5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrbp1Q99PL5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrbp1Q99PL5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrbp1Q99PL5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrbp1Q99PL5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms