Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GpnmbQ99P91 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms