Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nup155Q99P88 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup155Q99P88 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup155Q99P88 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms