Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Bco2Q99NF1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bco2Q99NF1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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