Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hdac9Q99N13 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hdac9Q99N13 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms