Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd1Q99MV1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tdrd1Q99MV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms