Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gdpd3Q99LY2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms