Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnpo2Q99LG2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnpo2Q99LG2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms