Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp16Q99LG0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp16Q99LG0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms