Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clint1Q99KN9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms