Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SmagpQ99KC7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms