Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp11Q99K46 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp11Q99K46 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms