Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlgn1Q99K10 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlgn1Q99K10 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms