Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrabdQ99JY4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TrabdQ99JY4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TrabdQ99JY4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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TrabdQ99JY4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TrabdQ99JY4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TrabdQ99JY4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms