Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims1Q99JW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms