Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GatbQ99JT1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms