Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pacsin3Q99JB8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms