Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ddb2Q99J79 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms