Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn16Q925N4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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