Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trim7Q923T7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms