Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sf3b5Q923D4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sf3b5Q923D4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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