Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TardbpQ921F2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms