Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EedQ921E6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EedQ921E6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EedQ921E6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EedQ921E6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EedQ921E6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EedQ921E6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms