Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l1Q920A7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms