Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pde6cQ91ZQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pde6cQ91ZQ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pde6cQ91ZQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pde6cQ91ZQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pde6cQ91ZQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pde6cQ91ZQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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