Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4bQ91ZP4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4bQ91ZP4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms