Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atl3Q91YH5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl3Q91YH5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms