Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usb1Q91W78 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usb1Q91W78 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms