Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp3Q91W36 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms