Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cabp4Q8VHC5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp4Q8VHC5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms