Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rhbdd2Q8VEK2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Rhbdd2Q8VEK2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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