Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmcd1Q8VEE1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmcd1Q8VEE1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms