Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx18Q8VDS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx18Q8VDS8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms