Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q8VDP2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q8VDP2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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