Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc6a20aQ8VDB9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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