Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tubg2Q8VCK3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tubg2Q8VCK3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms