Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApobrQ8VBT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms