Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RttnQ8R4Y8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms