Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mterf3Q8R3J4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mterf3Q8R3J4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms