Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r200Q8R281 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Vmn1r200Q8R281 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Vmn1r200Q8R281 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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