Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r212Q8R268 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms