Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg10Q8R1P4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg10Q8R1P4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms