Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CipcQ8R0W1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CipcQ8R0W1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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