Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2f4Q8R0K9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2f4Q8R0K9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms