Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sf3b4Q8QZY9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms